醫院潔凈手術室根據不同手術的類型分為四個不同的凈化級別：
特別潔凈手術室：手術區100級，周邊區1000級。
用于標準潔凈手術室：手術區1000級，周邊區10000級。
一般潔凈手術室：手術區10000級，周邊區100000級。
準潔凈手術室： 手術區100000級，周邊區300000級。
對于10000級的醫藥潔凈室，所要求的基本參數除了潔凈度級別外，為：換氣次數15-25 次/小時，相鄰房間壓力差5Pa（相對大氣壓力差不小于10Pa），溫度20-24℃，相對濕度45-60%。除了醫藥潔凈區之外，其余的輔助用房包括，氣閘室、更衣換鞋等輔助房間，都需要相應保證相應的溫度、相對濕度、壓力差、換氣次數和潔凈度。
醫院潔凈手術室自動控制的關鍵點：
風量檢測和控制：對于醫藥潔凈室的驗證，重要的環節就是對風量的檢測，從系統送風、新風、排風量到室內送風、回風、排風量，如果風量不達標，其他參數如潔凈度、靜壓值、溫濕度等便沒有實際意義。按照維護管理的要求，100級的區域，需要每周一次監測風量和風速；10000級或以上的區域，需要每月一次監測風量和風速。風量控制的效果終會影響到潔凈度。設計的原則是確保潔凈室的換氣次數，也就意味無論系統中初、中效過濾器以及潔凈室末端過濾器送風口的阻力發生變化時，要做到送入潔凈室的風量與送風系統阻力變化無關，始終保持送入潔凈室的風量恒定。為了達到潔凈室和相鄰房間有5Pa的壓力差，對室內的回風也必須有一個量的控制，有效的壓力控制方法是控制風量差，即恒定送風量，調整回風量，將潔凈室的壓力維持恒定，送、回風量的差值取決于潔凈室的密閉程度。
風量控制方法：使用先進的空氣流量調節閥--文丘里閥，裝在每個潔凈室的支風管或每個送、回風口上，在對每個房間送風量和回（排）風量在監測的同時進行控制，并且可以很方便地根據需要對風量進行重新設定。溫濕度控制將以潔凈室為標準，同時也滿足輔助房間的要求。通過安裝在空調系統中的高精度溫濕度傳感器，對空調機的冷卻量，加熱量和加濕量進行控制，達到恒溫、恒濕的要求。