（1）根據車間的防火、防爆、防腐蝕等生產性質，在空調設備訂貨時提出不同的要求。例如對于甲類生產車間，要求空調機組及與之配套的閥門、儀表等均采用防爆型；對于有排煙和事故通風要求的車間，切不可千篇一律的用空調機組兼作排煙或事故排風，而要經過技術經濟比較選擇合理的方案；對于生產工藝中散發大量酸性、堿性或腐蝕性氣體、液體的車間，對空調機組要進行防腐要求，通風管道要選擇合適的管材；對于設置于室外或屋面的空調設備，需要做好防腐、防雨和保溫措施。
（2）根據車間生產的產品有無潔凈度要求，在空調設備訂貨時提出不同的送風過濾功能。例如對于普通的生產車間，空調機組新風段后只需要進行一道粗效過濾；而對于有要求的潔凈區，新風段后需要一道粗效過濾，轉輪換熱后需要一道中效過濾，在送風機均流段后還需要一道中效過濾才能把空氣送入室內，以便有效的保護末端送風口。
（3）根據車間生產過程中有無大量粉塵或熱濕氣體等，在空調設備訂貨時提出不同的排風過濾功能。例如對于普通的生產車間，空調機組熱回收前排風段后只需要進行一道粗效過濾；對于散發熱濕氣體的房間，空調機組熱回收前排風段后需要進行一道中效過濾；而對于散發粉塵的房間應根據粉塵散發量分別考慮：若是散發微量的粉塵則空調機組熱回收前排風段后就需要進行過濾以便除塵并且有效的保護熱回收段；若是散發大量粉塵的系統則應考慮到僅采用過濾不足以除去所有粉塵，長期有粉塵經過熱回收轉輪即會減少使用壽命且在熱回收過程中不可避免的有粉塵送風進入潔凈區，并且經常性的更換過濾段還會大大增加設備造價，所以不建議對散發大量粉塵的潔凈區進行排風熱回收。
（4）根據車間生產過程中室內溫、濕度的控制要求和廠區的冷熱源情況，在空調設備訂貨時提出不同的表冷、加熱、加濕功能，以及采用顯熱還是全熱回收型轉輪。
（5）空調機組功能段組成有多樣性，一般都是把送風機設置在熱回收段及表冷、加熱、加濕等功能段后面，而排風機就有不同的設置方式，可根據實際的工程項目和合適的進風、排風方式選擇不同的風機設置位置和出風口方式。
（6）對于有消毒要求的潔凈空調系統，可在空調機組訂貨時提出在新風段上加設一個消毒用的風口或在空調機組內部增加消毒功能段（內置消毒液發生器）
（7）由于轉輪熱回收裝置的結果特性，在熱回收器后不可避免的會有部分排風進入送風系統，對排風污染有要求的工程就要進行特殊處理，比如在轉輪上增設一段扇形結構以犧牲部分新風來減少排風混合等措施。而對于一些嚴格禁止排風污染的化學生產過程就不能盲目的堅持采用轉輪熱回收空調系統。
在醫藥工業空調系統設計中適當的應用帶轉輪熱回收裝置的設計是科學可行適用并具有一定的節能效益的。而在今后的醫藥工業項目中，既要保證醫藥工業通過GMP2010的驗證，又要符合國家節能的相關要求，在這中間尋求一個合理的平衡，需要包括設計人員在內的所有人共同來參與研究探討從而得出更多可行的方案措施。