HVAC系統即暖通空調系統，是藥品生產質量控制系統的重要組成部分，通過其為藥品生產提供具有符合規定的溫度、濕度、懸浮粒子數、微生物等的環境，并對這些參數進行控制和監測，以避免污染和交叉污染，同時為操作人員提供舒適的環境。HVAC系統還能減少和避免藥品在生產過程中對人和周圍環境造成的不利影響，保護人的健康和周圍的環境。
一、空氣凈化
為保證潔凈室（區）的潔凈度，應采取措施：防止塵埃粒子從外部進入室內；防止室內產生塵埃粒子；及時排出已進入室內的塵埃粒子和室內產生的塵埃粒子。
進入潔凈室(區)的空氣須經多級過濾，以防止外界粒子進入室內；通過嚴格的生產及人員管理、潔凈室圍護結構合格規范的施工、合適材料等減少潔凈室（區）塵埃粒子的產生量；通過合理的排風和回風來及時排出室內的塵埃粒子。
空氣過濾器是空調凈化系統的核心設備。空氣流經過濾器時，空氣中的塵埃被各種作用，如攔截效應、慣性效應、擴散效應、重力效應、靜電效應等截留于過濾器。
按國家標準GB/T 14295-2008《空氣過濾器》和GB/T 13554-2008《高效空氣過濾器》，過濾器的分類及效率見下表。
過濾器額定風量下的效率和阻力：

高效空氣過濾器性能：

超高效空氣過濾器性能：

二、空氣過濾器的選用
1、空氣過濾器的選用和布置方式要求
（1）中效空氣過濾器宜集中設置在凈化空氣處理機組的正壓段；
（2）高效空氣過濾器或亞高效空氣過濾器宜設置在凈化空氣調節系統的末端；
（3）在回風和排風系統中，高效空氣過濾器和亞高效空氣過濾器及作為預過濾的中效過濾器應設置在系統的負壓段；
（4）中效空氣過濾器、高效空氣過濾器應按小于或等于額定風量選用；
（5）設置在同一潔凈區內的高效空氣過濾器、亞高效空氣過濾器運行時的阻力和效率宜相近。
2、過濾器選用的一般建議
（1）根據不同場所潔凈度的要求確定末級過濾器的效率；
（2）末級的高效過濾器選擇效率合適的前級過濾器；
（3）高效空氣過濾器必須逐臺檢測；
（4）選用通用尺寸的過濾器。
末端過濾器決定空氣的潔凈程度，前級過濾器起保護末端過濾器的作用，延長末端過濾器的使用周期，減少維護費用，保護凈化空調系統正常工作。過濾器的使用壽命除取決于其本身的優劣，如過濾材料、過濾面積、結構設計、初始阻力等，還與空氣中的含塵濃度、實際使用風量、終阻力的設定等因素有關。過濾器對空氣形成阻力，隨著過濾時間增加，積塵隨之增加，過濾器阻力也隨之增大。若過濾器積塵太多，阻力過高，通過風量降低，則使潔凈室（區）潔凈級別、溫濕度等不符合要求。因此，過濾器須設定使用周期，在過濾器沒有損壞的情況下，一般以阻力作為判定依據。