潔凈室的空調凈化系統運行能耗比一般舒適性空調運行能耗大得多，根據凈化級別不同，潔凈室空調凈化能耗是一般舒適性空調能耗的1.5~15倍，其單位面積的耗電量為0.1~1.0 Kw/m²。
① 為維持潔凈室所要求的溫度和相對濕度，要對潔凈室的送風進行必要的熱、濕處理（冷卻、去濕、加熱、加濕 ……），就必須向空調凈化系統供冷供熱，供蒸汽就要消耗大量的能量。
② 為了保證潔凈室的潔凈度，溫度、濕度等參數，必須往潔凈室送入大量的空氣，送風的風機和供水的水泵等動力設備也要消耗可觀的能量。
③ 上述的供冷、供熱、供蒸汽消耗的能量以及送風、送水設備消耗的電量隨潔凈級別越高，能量消耗越大。下表為不同級別潔凈室的能耗統計表。
④ 潔凈室的冷負荷中的主要負荷是新風冷負荷，消除工藝設備和工藝過程產熱的冷負荷和抵消風機和水泵發熱的冷負荷，這三項負荷占總冷負荷的90%以上；而圍護結構、照明和作業人員三項冷負荷不足總冷負荷的10%。