凈化工程中的空調系統通常由下面三大部分組成，即：空氣處理設備（通常是組合式凈化空調機組）、制冷循環設備及管道（通常是指冷水機組、熱泵機組及空調水系統等）、空氣循環設備及管道（通常是指風管、風閥、風口、過濾器等）等，每個部分都有其特定的功能與作用，它們相互配合完成了凈化工程的核心任務，是潔凈室溫度運行的重要保障。
1.空氣處理設備
空氣處理設備是凈化工程空調系統的核心部分，主要負責對空氣進行過濾、加熱、冷卻、加濕、去濕等處理。根據不同的處理需求，組合式空調機組可以配置不同的功能段，如過濾段、表冷段、加熱段、加濕段、去濕段等。下面就幾個代表的功能段進行解讀。
（1）過濾段：過濾段主要用于去除空氣中的塵埃、顆粒物等雜質，保證空氣的潔凈度。凈化工程中組合式空調機組多含有初（粗）效過濾器和中效過濾器，也有部分機組增設亞高效過濾器。
（2）表冷段：表冷段是空氣冷卻的主要設備，它通過制冷劑在表冷器內的蒸發吸收空氣的熱量，實現空氣的降溫。表冷段的性能直接影響到整個空調系統的制冷效果和能耗。
（3）加熱段：加熱段主要用于在冬季或需要提高室內溫度時，對空氣進行加熱處理。加熱段通常采用電加熱、蒸汽加熱或熱水加熱等方式，能夠快速、均勻地提高室內溫度。
（4）加濕段：加濕段主要用于在空氣過于干燥時，對空氣進行加濕處理。加濕段通常采用電極式加濕器、超聲波加濕器等設備，能夠向空氣中添加適量的水蒸氣，提高室內空氣的濕度。
（5）去濕段：去濕段主要用于在空氣濕度過高時，對空氣進行去濕處理，凈化工程中電子潔凈廠房、半導體廠房常會伴有低濕度需求，此時就需要額外增設去濕設備。去濕段通常采用冷凝去濕、轉輪去濕等方式，能夠有效地去除空氣中的多余水分，保持室內空氣的干燥和舒適。
2.制冷循環設備及管道
制冷循環設備及管道是凈化工程中空調系統的另一個重要組成部分，它其實主要由制冷機組和空調水管道組成。制冷機組不多贅述。
空調機組主要由四大件組成，即：壓縮機、冷凝器、蒸發器、節流裝置（也稱節流閥），制冷機組負責實現制冷劑的循環和制冷過程，空調水管道及配件將冷水機組內的冷凍水輸送給組合式凈化空調機組。
（1）壓縮機：壓縮機是整個制冷循環系統的核心部件，它能夠將制冷劑從低壓低溫狀態壓縮成高壓高溫狀態，為制冷循環提供動力。
（2）冷凝器：冷凝器是制冷劑在高壓高溫狀態下釋放熱量的設備，它通常位于室外或機房內，通過風扇將室外空氣吹過冷凝器表面，帶走制冷劑釋放的熱量。
（3）蒸發器：蒸發器是制冷劑在低壓低溫狀態下吸收熱量的設備，它通常位于空氣處理段內，通過制冷劑在蒸發器內的蒸發吸收空氣的熱量，實現空氣的降溫。
（4）節流裝置：節流裝置用于控制制冷劑在循環過程中的流量和壓力，保證制冷循環的穩定性和高效性。
（5）空調水管道：這里所說的空調水管道指冷凍水管道。空調水管道與泵組、定壓裝置、水處理裝置、閥門等附件共同解決了凈化工程空調系統的冷源供給。
3.空氣循環設備及管道
空氣循環設備及管道主要負責將處理后的空氣輸送到室內各個空間，并保證室內空氣的流通和均勻分布。空氣循環設備及管道通常由風機（送風機其實在組合式空調機組內、排風機多為單獨設置）、送風管道、回風管道等組成。
（1）風機：風機是空氣循環段的動力源，它能夠將室內的空氣吸入并通過送風管道輸送到各個空間。同時，風機還能夠調節送風量的大小和風速的快慢，以滿足不同空間對空氣的需求，是控制潔凈室能夠滿足潔凈度要求的重要措施。
（2）送風管道、回風管道和排風管道：送風管道和回風管道分別用于將處理后的空氣輸送到室內和將室內的空氣回收到空調機組中進行再處理，排風管道主要將潔凈室內廢氣排出室外，其實還有新風管道，顧名思義就是為潔凈室提供新風。送風管道和回風/排風管道的設計應合理布局，以保證室內空氣的流通和均勻分布。