伴隨著醫學技術進步及人民生活水平、健康狀況的提高，在臨床上大量使用一次性醫療衛生用品，這給處理醫療廢棄物帶來巨大困難。其中主要原因是醫廢管理技術水平、硬件水平等滯后于目前社會經濟的發展，因此造成我國醫廢處理和管理水平的滯后，帶來醫療廢棄物回收處理中存在的種種問題，未來行業發展還需進一步規范。
我國對醫療廢物的處置長期重視不夠，集中處置設施建設嚴重滯后，大部分危險廢物處于低水平綜合利用、簡單貯存或直接排放狀態。具體來說，目前處理的方式主要有五種，即將醫廢賣給小販、隨意丟棄醫廢、將醫廢混入生活垃圾、直接焚燒填埋醫廢、集中回收處理醫廢。
由于缺乏監管力度、管理不嚴等問題，上述五種處理方式都存在不同程度的隱患，嚴重的可能危及人體健康。更令人擔憂的是，醫療廢棄物的產生量在大幅提升，進一步加劇處理醫療廢棄物的壓力。數據顯示，我國醫療廢棄物產生量已從2005年的75.12萬噸增至2016年的185.49萬噸。不過，醫療廢棄物處理方式存在問題以及產生量的增加，表明醫療廢棄物處理行業存在很大機遇。據此估算，2016年，我國醫療廢棄物處理市場規模達65.13億元，且仍保持較快發展態勢。隨著醫療服務提升，醫療廢物處理行業還有很大提升空間。
長遠來看，醫療廢棄物處理行業前景廣闊，但存在的問題不容忽視，未來發展必須注重解決以下幾大痛點。
一、醫院內部管理混亂。目前一些醫療機構沒有嚴格消毒處理醫廢，醫院相關醫廢管理部沒有直接參與到監督檢查工作當中，而聘請沒有經過專業培訓的臨時工專職或者兼職負責處理醫療廢棄物。
二、醫廢分類收集體系不完善。醫廢分類收集是醫廢處理中比較重要的環節，但是目前不少醫院經常會將醫廢當做生活垃圾進行處理，兩者混雜在一起進行填埋或者焚燒。
三、不夠重視醫廢的危害性。由于相關健康衛生知識普及的程度有限，目前不夠重視醫廢對環境和自身健康的危害性。另外，一些醫務人員對醫廢真正的危險性仍然認識不足，仍然會發生隨意丟棄醫廢，消毒不合格這類的事件。
四、相關法規和監管不健全。國內目前主要由環衛、環保、衛生三個部門來共同管理醫療廢棄物處理，但是這三個部門在管理醫療廢棄物處理方面分工仍不太明確，這也導致了國內醫療廢棄物管理發展較為緩慢。
五、可回收制品沒有得到科學的回收利用。很大一部分的醫療廢棄物是可以進行回收處理利用的，但卻沒有得到合理回收處理，或者回收處理手段不科學，造成環境污染和資源的浪費。
六、運輸過程及物流網絡的問題。醫療廢棄物回收物流不同于其他廢舊物資回收物流，對用于回收醫療廢棄物的運輸設備和包裝容器有一定的技術要求，另外醫廢運輸設備也需要專業化配置。
七、處理費用問題。關于我國醫廢處理費用收取標準方面，目前有兩類標準，*類標準是按醫廢重量收費;第二類標準是按相關醫廢產生的醫療單位的床位收費，并且處理費用在全國各地也相差很大，而且并未正式納入醫療成本。